A embriologia e a genética são consideradas uma das mais difíceis disciplinas para estudantes do ensino superior; assim, diferentes métodos de ensino devem ser utilizados para facilitar o seu processo de ensino-aprendizagem e tornar os alunos os protagonistas de seus saberes. Neste relato de experiência, foi avaliado o emprego de aulas práticas de laboratório como método de ensino das disciplinas de embriologia e genética para alunos do 2º período do curso de medicina. Os dados coletados nos questionários avaliativos demonstraram que o uso de aulas práticas favoreceu a aprendizagem dos conteúdos e o desenvolvimento do pensamento científico, além de aumentar a motivação dos alunos e promover o trabalho em grupo.